在台灣，南部兩個縣市爆發高致病性H5N2禽流感後，當局銷毀了超過六萬隻雞，南投亦有雞隻驗到對H5N2呈陽性反應。
馬英九總統認為，農委會必須對延遲公布疫情向民眾道歉，檢討懲處相關人員責任，防疫局長提出請辭獲批。
當局在彰化的養雞場銷毀所有雞隻後，防疫人員在現場噴灑消毒劑，另外又會在三公里半徑範圍內的其他雞場，採集雞隻血液和嚥喉分泌物樣本化驗，監察疫情有否擴散。
另一個同樣爆發疫情的台南養雞場，都有這樣做。鄰近的南投亦有雞場的雞，驗到H5N2呈陽性反應。
做過記者、過去幾年拍紀錄片，追縱禽流感疫情的導演李惠仁，質疑當局一直用各種方式拖延或隱瞞疫情。
他表示，早在去年12月，懷疑彰化縣有疫情，將死雞樣本寄予防疫局局長許天來要求跟進，但對方沒有受理。
許天來否認失職，指以為李惠仁寄來的包裹是禮物，所以拒收。
李惠仁批評當局假如正視疫情，就不用拖延了70日才決定殺雞。
農委會向公眾致歉，強調當初的化驗結果，H5N2不明顯，雞場亦沒有大批雞隻死亡。
但農委會批准防疫局長許天來的辭職，至於當中有沒有隱瞞疫情，會主動交給監察院調查。
當局強調，H5N2不會傳染給人，呼籲民眾不用太恐慌。但即日起，台灣的禽肉、禽蛋和寵物鳥在內，暫停出口至美、加等地，觀察期三個月，農業部初步估計損失至少六億元新台幣。
