iPS細胞研究開闢了再生醫療的路向，日本研究人員期望透過這種新技術，可以攻克一直以來難以治癒的重度心臟病和神經系統疾病。
當地相關業界抱有很大期望，在再生醫療相關設備方面，預計在2015至2020年內的市場規模，會達到數千億日圓。日本各製藥公司亦開始嘗試，使用iPS細胞技術來開發新藥物。
iPS細胞具有很多優勢，例如是不需要利用胚胎細胞或卵子細胞，不會衍生出倫理問題。
在實際應用上，要獲取iPS細胞的方法，相對簡單，加上病人可以用自己的體內細胞，來培植iPS細胞，不會產生有免疫排斥的問題。
不過，這種新技術也有缺陷。與胚胎幹細胞相比，iPS細胞要分化發育成全身各類細胞的能力較低。日本九州大學學者更加提出，iPS細胞有發育成癌細胞的危險。
