賴昌星案不單牽連廈門巿和海關，連省政以至全國機關亦有高層幹部涉案，包括總參謀部情報部常務副部長、中共元老姬鵬飛兒子姬勝德、公安部副部長李紀周、福建省委原副書記等等，一旦引渡回中國受審，可能會供出更多當年涉案高官的內幕。
路透有分析認為，矛頭更會直指，當年是福建省委書記賈慶林。
目前是政治局常委、政協主席賈慶林，位高權重，根據編制是中共第四號人物。在遠華集團發跡之時，是福建省黨機關第一把手，妻子林幼芳，是福建外貿集團黨組書記，主管外貿活動。賴昌星接受傳媒訪問時，證實他認識賈慶林夫婦，雙方曾經有往來。
但賈慶林夫婦一直無捲入案件，賈慶林仕途依然平步青雲，有傳當年是前總書記江澤民，一手力薦他入政治局，他亦被外界視為江派人馬。不過分析相信，江澤民一日仍然在生，仍有能力保護賈慶林。
總書記胡錦濤方面，估計亦無意動搖賈慶林地位，避免在明年政權交替之時，引起政壇震蕩。
