日本高度關注中國成立新的國家海洋管理局，認為中國的目的在針對釣魚島爭議，加強對釣魚島及南海海域的監控。
中國國務院向人大提交的機構改革方案，將多個海上執法部門整合成國家海洋管理局，日本傳媒普遍相信，中國此舉是想加強對釣魚島的監視，認為日方要作好準備應對。
日本共同社引述防衛省防衛研究所，在去年2月發表有關中國安全的報告，比較日中的船艦實力規模，指日本海上保安廳擁有49艘1000噸級以上的大型巡邏船，而隸屬中國海洋局海監總隊的同級船艦只有27艘，但經整合後，海洋局的船艦數目將會增至38艘，而以往各部門各自為政的情況亦會改善，有助提高效率。
另外，海洋局計劃在2015年底前建造36艘中型及大型巡邏船，當中包括7艘1500噸級的巡邏船，明顯是意圖想趕上日方的巡邏艦船隊規模。
報道又指，雖然海洋局整合後，未能升級成為部級機構，但權限擴大了很多，意味海監船有可能獲賦予警察權，在釣魚島及南海海域宣示主權時，不再限於只能以電子屏幕及無線電等行政手段，可能有權將其他國家船隻上的人員，當作疑犯拘留，甚至會在海監船上配置武器。
