神九飛船會在內蒙古四子王旗著陸，預計屆時天氣良好，適合降落。
神九返回艙著陸過程，分為4個階段。首先，地面控制中心向神九發出返回指令，飛船隨即調整姿態，發動機點火制動，飛船進入返回軌道。其後，飛船會以無動力飛行狀態自由下降，降到去離地面140公里時，推進艙和返回艙分離。
進入大氣層時，推進艙燒毀，返回艙就和大氣層摩擦產生高熱，形成高溫等離子氣體層，即是黑障，因而和地面失去聯繫4分鐘。
直至離地四十公里才恢復。最後的著陸階段最為關鍵。返回艙離地大約１０公里時，巨型降落傘會打開，離地１．２米時，４個反推動機啟動，令飛船減速著陸，這樣做可以減低衝擊力，保障航天員和儀器安全。
在內蒙古四子王旗主著陸場的搜救隊和回收隊會出動7架直升機，包括一架新增負責測向定位的通信直升機，目標是在兩個半小時內找到返回艙。
四子王旗星期四朝早有微雨，但預料到了星期五就會見到藍天白雲，氣溫24度，風速每秒4至6米，很適合返回艙著陸。
