槍擊事件發生後，台灣對菲律賓實施暫停處理外勞申請、發出紅色旅遊警示等十一項制裁措施，要求討回公道，一度令台菲關係惡化。
事實上，措施對兩地經濟，帶來一定影響。根據台灣的職訓局統計，由五月中制裁至今，大約一萬四千名菲律賓外勞，無法到台灣工作，粗略推算菲律賓損失的外匯收入，達到四億新台幣。
旅遊同樣受到影響，今年上半年，菲律賓往台灣的旅客只是4萬9千人，較去年同期少了4600人，跌幅接近百分之九。
台灣民眾的反應更強烈，估計這兩、三月內，逾一萬人放棄前往菲律賓旅遊，相關的收入，損失過億新台幣。台灣一直是菲律賓第五大的遊客來源，業界希望制裁能夠早日結束。
台灣一直要求菲律賓落實道歉、賠償、懲處兇徒、進行漁業談判才會解除制裁。菲律賓派員道歉，台灣認為已經收到正面回應，馬英九總統亦對結果感到欣慰，因此取消制裁，不過言論再引發綠營人士不滿。
民眾批評菲律賓，仍未起訴涉案的海岸防衛隊人員，根本不算已經懲處兇徒，政府匆匆考慮解除制裁，明顯是有政治考慮，又說馬英九是受到美國的施壓，急於在星期日，出發前往中南美洲訪問，在過境美國前示好。
另外，事件已經對台菲民間交流造成衝擊，菲律賓籃球隊，日前在亞錦賽主場不敵中華台北，菲律賓的教練竟然再說出，帶挑釁性的言論。
