國務院調查組第一次全體會議結束，上海鐵路局表示，事故的原因是列車信號設備在設計上存在嚴重缺陷，加上人為疏忽，導致慘劇發生。
國務院就溫州鐵路事故成立的調查組在溫州召開第一次全體會議，上海鐵路局局長安路生指，初步分析事故原因，與信號設備設計出錯有關。
他說，由於溫州南站信號設備在設計上存在嚴重缺陷，遭雷擊發生故障後，導致本應顯示紅燈的區間信號機，錯誤升級顯示為綠燈。
安路生亦說，電務值班人員沒有意識到信號可能錯誤顯示。而溫州南站值班員亦未能及時發現信號出錯，通知相關列車。
事故顯示設備品質和現場控制有問題，人員培訓和安全意識不足，反映鐵道部門的安全管理不到位。
出任調查組組長的國家安監總局局長駱琳說，將高度重視媒體網友提出的疑問，徹查事故原因，預計報告可以在九月中完成，向社會公布。
存在缺陷的信號設備由北京全路通號研究設計院設計，09年9月投入使用。設計院向死傷者和家屬發出道歉信，指會積極配合調查，承擔和追究相關人士的責任。
內地傳媒報道，設備硬件來自卡斯柯信號公司，經檢查後並無問題，問題出在軟件上，由中國鐵路通號集團提供。
