黑客攻擊爭議，被視為可能會影響今次中美峰會成果。奧巴馬說，他和習近平同意兩國要合作，監管網絡安全。
中美國家元首選擇在，加州一個莊園舉行非正式會晤，有營造輕鬆氣氛、加強個人交流的意味，但會前美方一再指摘中國黑客，對美國發動網絡攻擊，令會談蒙上陰影。
奧巴馬在首場會談後表示，他和習近平都認為必須訂立共同守則，應付網絡安全這個棘手問題。習近平表示，中國亦是黑客攻擊的受害者，對這個問題嚴重關注，中方堅決維護網絡安全，中美兩國要共同研究解決問題的方法。
不過二人會面前夕，就再次傳出，懷疑有中國政府黑客，入侵美國網絡的消息，今次還牽涉到奧巴馬。美國傳媒引述消息報道，2008年，奧巴馬和共和黨參議員麥凱恩競選總統期間，競選陣營的網絡同樣遭到黑客入侵，懷疑是中方監視美國總統候選人的對華政策。
其中，曾經替麥凱恩助選的國務院前官員施賴弗，近日透露，當年七月麥凱恩曾經草擬一封信，給剛上台的台灣領導人馬英九，內容大致表示支持他，和支持台灣軍備現代化，但信件未寄出，就有中國官員接觸麥凱恩陣營，批評信件內容，因此他們懷疑是否遭到中方黑客入侵網絡。
奧巴馬陣營方面，亦收到當時的喬治布殊政府通報，說他們的電腦已經受人控制，至於懷疑是中國黑客所為，亦是近日才披露。
