在台灣，馬英九總統再次就漁民被菲律賓人員槍殺事件，召開國安高層會議，有可能會對菲律賓啟動第三波的制裁行動。至於日前派到菲律賓調查事件的小組，已經返回台灣。
台灣當局派出的17人調查團無功而還，返回台灣，並隨即開記者會，再次強調事前已知會菲律賓，會就台灣漁民遭槍殺事件到當地調查，但菲律賓方面毫無誠意合作調查，調查團才決定返台。
臨離開菲律賓前，調查團展示菲律賓駐台代表白熙禮同意合作調查的信件，重申程序上並無不當。
調查團表示，雖然今次處處遭到菲律賓的阻撓，但小組稍後會再到菲律賓。不過，菲律賓總統府副發言人回應，指沒有怠慢台灣的調查團，強調必須有一套法律程序，才能展開聯合調查。
至於菲律賓第一階段調查報告，將於下星期公布，之後計劃派調查人員到台灣。
對於菲律賓海岸防衛隊的調查報告，將責任放在台灣漁船越界捕魚上。有當地調查人員透過馬尼拉公報報料，指菲律賓海防隊在事件中可能違反了交戰規定。內容指如果公務船只是正當防衛，這麼密集的開火很不尋常，因為按規定，只有在公務船或船上的人遭到直接開槍擊，才能鳴槍示警。
菲律賓至今亦不願意將最重要的證據，當時的影片公開。
